Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Gm18164-201ENSMUST00000213769 927 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Gm18166-201ENSMUST00000215557 927 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Bcorl1-203ENSMUST00000136348 7446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Zfyve26-201ENSMUST00000021547 9391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Cacna1c-210ENSMUST00000187474 6911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Sorcs1-208ENSMUST00000211687 7080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Kif14-201ENSMUST00000047817 8770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms