Protein–RNA interactions for Protein: F6VAN0

Atf6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6F6VAN0 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms