Protein–RNA interactions for Protein: E9QAJ8

Gm3468, Predicted gene 3468, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3468E9QAJ8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3468E9QAJ8 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3468E9QAJ8 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3468E9QAJ8 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3468E9QAJ8 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3468E9QAJ8 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3468E9QAJ8 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3468E9QAJ8 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3468E9QAJ8 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3468E9QAJ8 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3468E9QAJ8 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Gm3468E9QAJ8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3468E9QAJ8 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3468E9QAJ8 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3468E9QAJ8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3468E9QAJ8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3468E9QAJ8 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3468E9QAJ8 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3468E9QAJ8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Gm3468E9QAJ8 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3468E9QAJ8 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3468E9QAJ8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3468E9QAJ8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3468E9QAJ8 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3468E9QAJ8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3468E9QAJ8 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Gm3468E9QAJ8 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3468E9QAJ8 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Gm3468E9QAJ8 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3468E9QAJ8 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3468E9QAJ8 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3468E9QAJ8 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3468E9QAJ8 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3468E9QAJ8 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3468E9QAJ8 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3468E9QAJ8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3468E9QAJ8 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3468E9QAJ8 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
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Gm3468E9QAJ8 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3468E9QAJ8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Gm3468E9QAJ8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Gm3468E9QAJ8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3468E9QAJ8 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3468E9QAJ8 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3468E9QAJ8 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Gm3468E9QAJ8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Gm3468E9QAJ8 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3468E9QAJ8 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Gm3468E9QAJ8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3468E9QAJ8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Gm3468E9QAJ8 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3468E9QAJ8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3468E9QAJ8 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3468E9QAJ8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3468E9QAJ8 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3468E9QAJ8 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3468E9QAJ8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3468E9QAJ8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3468E9QAJ8 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3468E9QAJ8 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3468E9QAJ8 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3468E9QAJ8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3468E9QAJ8 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3468E9QAJ8 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3468E9QAJ8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3468E9QAJ8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3468E9QAJ8 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3468E9QAJ8 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3468E9QAJ8 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3468E9QAJ8 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms