Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TrdnE9Q9K5 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms