Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8F9

6030445D17Rik, RIKEN cDNA 6030445D17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030445D17RikE9Q8F9 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
6030445D17RikE9Q8F9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms