Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Urb2E9Q7L1 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms