Protein–RNA interactions for Protein: E9Q612

Ptpro, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, mousemouse

Predictions only

Length 1,226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtproE9Q612 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtproE9Q612 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms