Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4S1

Pde8b, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8B, mousemouse

Predictions only

Length 865 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde8bE9Q4S1 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Pde8bE9Q4S1 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pde8bE9Q4S1 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pde8bE9Q4S1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pde8bE9Q4S1 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pde8bE9Q4S1 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pde8bE9Q4S1 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pde8bE9Q4S1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pde8bE9Q4S1 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pde8bE9Q4S1 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pde8bE9Q4S1 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pde8bE9Q4S1 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pde8bE9Q4S1 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pde8bE9Q4S1 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pde8bE9Q4S1 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pde8bE9Q4S1 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pde8bE9Q4S1 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pde8bE9Q4S1 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pde8bE9Q4S1 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pde8bE9Q4S1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pde8bE9Q4S1 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pde8bE9Q4S1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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