Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
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ApobE9Q414 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
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