Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
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Ccdc171E9Q1U1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
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Ccdc171E9Q1U1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
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Ccdc171E9Q1U1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
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Ccdc171E9Q1U1 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
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Ccdc171E9Q1U1 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
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Ccdc171E9Q1U1 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
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Ccdc171E9Q1U1 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
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Ccdc171E9Q1U1 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
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Ccdc171E9Q1U1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
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Ccdc171E9Q1U1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
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Ccdc171E9Q1U1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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Ccdc171E9Q1U1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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