Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1T6

Lrp3, Low density lipoprotein receptor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp3E9Q1T6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lrp3E9Q1T6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Lrp3E9Q1T6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Lrp3E9Q1T6 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Lrp3E9Q1T6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Lrp3E9Q1T6 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Lrp3E9Q1T6 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrp3E9Q1T6 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrp3E9Q1T6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrp3E9Q1T6 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrp3E9Q1T6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrp3E9Q1T6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrp3E9Q1T6 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrp3E9Q1T6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrp3E9Q1T6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrp3E9Q1T6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrp3E9Q1T6 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrp3E9Q1T6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrp3E9Q1T6 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrp3E9Q1T6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrp3E9Q1T6 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrp3E9Q1T6 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrp3E9Q1T6 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrp3E9Q1T6 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrp3E9Q1T6 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrp3E9Q1T6 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrp3E9Q1T6 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrp3E9Q1T6 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrp3E9Q1T6 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrp3E9Q1T6 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrp3E9Q1T6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrp3E9Q1T6 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrp3E9Q1T6 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrp3E9Q1T6 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrp3E9Q1T6 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrp3E9Q1T6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrp3E9Q1T6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrp3E9Q1T6 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrp3E9Q1T6 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrp3E9Q1T6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrp3E9Q1T6 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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