Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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Ddx60E9PZQ1 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ddx60E9PZQ1 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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Ddx60E9PZQ1 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ddx60E9PZQ1 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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Ddx60E9PZQ1 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ddx60E9PZQ1 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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Ddx60E9PZQ1 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ddx60E9PZQ1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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Ddx60E9PZQ1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ddx60E9PZQ1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Ddx60E9PZQ1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Ddx60E9PZQ1 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ddx60E9PZQ1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Ddx60E9PZQ1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Ddx60E9PZQ1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Ddx60E9PZQ1 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ddx60E9PZQ1 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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