Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Brd1E9PZ26 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Brd1E9PZ26 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Brd1E9PZ26 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Brd1E9PZ26 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Brd1E9PZ26 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Brd1E9PZ26 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Brd1E9PZ26 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Brd1E9PZ26 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Brd1E9PZ26 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Brd1E9PZ26 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Brd1E9PZ26 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Brd1E9PZ26 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Brd1E9PZ26 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Brd1E9PZ26 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Brd1E9PZ26 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brd1E9PZ26 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brd1E9PZ26 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brd1E9PZ26 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brd1E9PZ26 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brd1E9PZ26 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brd1E9PZ26 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brd1E9PZ26 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brd1E9PZ26 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brd1E9PZ26 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brd1E9PZ26 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brd1E9PZ26 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brd1E9PZ26 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Brd1E9PZ26 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brd1E9PZ26 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Brd1E9PZ26 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brd1E9PZ26 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brd1E9PZ26 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brd1E9PZ26 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brd1E9PZ26 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brd1E9PZ26 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brd1E9PZ26 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brd1E9PZ26 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brd1E9PZ26 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brd1E9PZ26 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Brd1E9PZ26 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Brd1E9PZ26 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Brd1E9PZ26 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Brd1E9PZ26 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Brd1E9PZ26 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms