Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms