Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms