Protein–RNA interactions for Protein: E9PVF1

Gm6904, Predicted gene 6904, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6904E9PVF1 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6904E9PVF1 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6904E9PVF1 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6904E9PVF1 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6904E9PVF1 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6904E9PVF1 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6904E9PVF1 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6904E9PVF1 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6904E9PVF1 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6904E9PVF1 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6904E9PVF1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6904E9PVF1 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6904E9PVF1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6904E9PVF1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6904E9PVF1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6904E9PVF1 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6904E9PVF1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6904E9PVF1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6904E9PVF1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6904E9PVF1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm6904E9PVF1 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm6904E9PVF1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm6904E9PVF1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm6904E9PVF1 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm6904E9PVF1 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm6904E9PVF1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm6904E9PVF1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm6904E9PVF1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm6904E9PVF1 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm6904E9PVF1 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm6904E9PVF1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm6904E9PVF1 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm6904E9PVF1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm6904E9PVF1 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm6904E9PVF1 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm6904E9PVF1 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm6904E9PVF1 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm6904E9PVF1 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm6904E9PVF1 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm6904E9PVF1 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm6904E9PVF1 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm6904E9PVF1 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm6904E9PVF1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm6904E9PVF1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm6904E9PVF1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm6904E9PVF1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm6904E9PVF1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm6904E9PVF1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm6904E9PVF1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm6904E9PVF1 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm6904E9PVF1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm6904E9PVF1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm6904E9PVF1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm6904E9PVF1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm6904E9PVF1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm6904E9PVF1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm6904E9PVF1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm6904E9PVF1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm6904E9PVF1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm6904E9PVF1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm6904E9PVF1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm6904E9PVF1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm6904E9PVF1 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm6904E9PVF1 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Gm6904E9PVF1 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm6904E9PVF1 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm6904E9PVF1 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm6904E9PVF1 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm6904E9PVF1 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm6904E9PVF1 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm6904E9PVF1 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm6904E9PVF1 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm6904E9PVF1 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm6904E9PVF1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm6904E9PVF1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm6904E9PVF1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm6904E9PVF1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm6904E9PVF1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm6904E9PVF1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm6904E9PVF1 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm6904E9PVF1 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm6904E9PVF1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm6904E9PVF1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm6904E9PVF1 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm6904E9PVF1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm6904E9PVF1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm6904E9PVF1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm6904E9PVF1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm6904E9PVF1 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm6904E9PVF1 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm6904E9PVF1 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm6904E9PVF1 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm6904E9PVF1 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm6904E9PVF1 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm6904E9PVF1 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm6904E9PVF1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm6904E9PVF1 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm6904E9PVF1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm6904E9PVF1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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