Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms