Protein–RNA interactions for Protein: E9PUD6

Zscan18, Zinc finger and SCAN domain-containing 18, mousemouse

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan18E9PUD6 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zscan18E9PUD6 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms