Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4S3

Ptrhd1, Putative peptidyl-tRNA hydrolase PTRHD1, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptrhd1D3Z4S3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptrhd1D3Z4S3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptrhd1D3Z4S3 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptrhd1D3Z4S3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptrhd1D3Z4S3 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptrhd1D3Z4S3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptrhd1D3Z4S3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptrhd1D3Z4S3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms