Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms