Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ2

Tgfbr3l, Transforming growth factor, beta receptor III-like, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr3lD3YZZ2 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms