Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms