Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms