Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms