Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms