Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Siah3B2RWG3 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms