Protein–RNA interactions for Protein: B2RV77

Gm5483, MCG130182, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5483B2RV77 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5483B2RV77 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5483B2RV77 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5483B2RV77 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5483B2RV77 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5483B2RV77 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5483B2RV77 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5483B2RV77 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5483B2RV77 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5483B2RV77 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5483B2RV77 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5483B2RV77 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5483B2RV77 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5483B2RV77 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5483B2RV77 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5483B2RV77 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5483B2RV77 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5483B2RV77 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5483B2RV77 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5483B2RV77 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5483B2RV77 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5483B2RV77 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5483B2RV77 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5483B2RV77 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5483B2RV77 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5483B2RV77 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5483B2RV77 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5483B2RV77 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5483B2RV77 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5483B2RV77 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5483B2RV77 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5483B2RV77 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5483B2RV77 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5483B2RV77 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5483B2RV77 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5483B2RV77 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5483B2RV77 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5483B2RV77 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5483B2RV77 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5483B2RV77 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5483B2RV77 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5483B2RV77 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5483B2RV77 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5483B2RV77 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5483B2RV77 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5483B2RV77 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5483B2RV77 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5483B2RV77 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5483B2RV77 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5483B2RV77 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5483B2RV77 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5483B2RV77 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5483B2RV77 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5483B2RV77 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5483B2RV77 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5483B2RV77 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5483B2RV77 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5483B2RV77 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gm5483B2RV77 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gm5483B2RV77 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gm5483B2RV77 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms