Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Abcc8B2RUS7 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
Abcc8B2RUS7 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Abcc8B2RUS7 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Abcc8B2RUS7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Abcc8B2RUS7 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Abcc8B2RUS7 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Abcc8B2RUS7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Abcc8B2RUS7 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Abcc8B2RUS7 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Abcc8B2RUS7 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Abcc8B2RUS7 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Abcc8B2RUS7 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Abcc8B2RUS7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Abcc8B2RUS7 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Abcc8B2RUS7 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Abcc8B2RUS7 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Abcc8B2RUS7 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
Abcc8B2RUS7 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Abcc8B2RUS7 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Abcc8B2RUS7 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Abcc8B2RUS7 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Abcc8B2RUS7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Abcc8B2RUS7 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Abcc8B2RUS7 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Abcc8B2RUS7 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Abcc8B2RUS7 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Abcc8B2RUS7 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
Abcc8B2RUS7 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Abcc8B2RUS7 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
Abcc8B2RUS7 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Abcc8B2RUS7 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Abcc8B2RUS7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Abcc8B2RUS7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Abcc8B2RUS7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Abcc8B2RUS7 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Abcc8B2RUS7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Abcc8B2RUS7 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Abcc8B2RUS7 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Abcc8B2RUS7 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Abcc8B2RUS7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Abcc8B2RUS7 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Abcc8B2RUS7 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Abcc8B2RUS7 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Abcc8B2RUS7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Abcc8B2RUS7 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Abcc8B2RUS7 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Abcc8B2RUS7 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
Abcc8B2RUS7 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
Abcc8B2RUS7 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
Abcc8B2RUS7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Abcc8B2RUS7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Abcc8B2RUS7 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Abcc8B2RUS7 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Abcc8B2RUS7 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Abcc8B2RUS7 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Abcc8B2RUS7 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Abcc8B2RUS7 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Abcc8B2RUS7 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Abcc8B2RUS7 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Abcc8B2RUS7 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
Abcc8B2RUS7 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Abcc8B2RUS7 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Abcc8B2RUS7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Abcc8B2RUS7 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Abcc8B2RUS7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Abcc8B2RUS7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Abcc8B2RUS7 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Abcc8B2RUS7 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Abcc8B2RUS7 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Abcc8B2RUS7 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Abcc8B2RUS7 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Abcc8B2RUS7 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Abcc8B2RUS7 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Abcc8B2RUS7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Abcc8B2RUS7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Abcc8B2RUS7 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Abcc8B2RUS7 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Abcc8B2RUS7 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Abcc8B2RUS7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Abcc8B2RUS7 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Abcc8B2RUS7 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Abcc8B2RUS7 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Abcc8B2RUS7 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Abcc8B2RUS7 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Abcc8B2RUS7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Abcc8B2RUS7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Abcc8B2RUS7 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Abcc8B2RUS7 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
Abcc8B2RUS7 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Abcc8B2RUS7 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Abcc8B2RUS7 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Abcc8B2RUS7 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Abcc8B2RUS7 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Abcc8B2RUS7 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Abcc8B2RUS7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Abcc8B2RUS7 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Abcc8B2RUS7 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Abcc8B2RUS7 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Abcc8B2RUS7 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms