Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms