Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Spocd1B1ASB6 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms