Protein–RNA interactions for Protein: A2RTF1

Catsperb, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatsperbA2RTF1 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CatsperbA2RTF1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms