Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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Rtf1A2AQ19 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
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Rtf1A2AQ19 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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Rtf1A2AQ19 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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Rtf1A2AQ19 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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Rtf1A2AQ19 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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Rtf1A2AQ19 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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Rtf1A2AQ19 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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