Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms