Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms