Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Frmpd1A2AKB4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Frmpd1A2AKB4 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Frmpd1A2AKB4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Frmpd1A2AKB4 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Frmpd1A2AKB4 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms