Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lcn6A2AJB9 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lcn6A2AJB9 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lcn6A2AJB9 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lcn6A2AJB9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lcn6A2AJB9 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lcn6A2AJB9 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lcn6A2AJB9 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Lcn6A2AJB9 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lcn6A2AJB9 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lcn6A2AJB9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lcn6A2AJB9 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lcn6A2AJB9 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lcn6A2AJB9 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lcn6A2AJB9 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Lcn6A2AJB9 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Lcn6A2AJB9 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Lcn6A2AJB9 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lcn6A2AJB9 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lcn6A2AJB9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lcn6A2AJB9 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lcn6A2AJB9 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lcn6A2AJB9 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lcn6A2AJB9 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lcn6A2AJB9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Lcn6A2AJB9 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Lcn6A2AJB9 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Lcn6A2AJB9 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Lcn6A2AJB9 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Lcn6A2AJB9 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lcn6A2AJB9 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lcn6A2AJB9 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lcn6A2AJB9 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lcn6A2AJB9 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Lcn6A2AJB9 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lcn6A2AJB9 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lcn6A2AJB9 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lcn6A2AJB9 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lcn6A2AJB9 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lcn6A2AJB9 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lcn6A2AJB9 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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