Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms