Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Itgb4A2A863 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms