Protein–RNA interactions for Protein: A2A4P4

Gm27029, Predicted gene, 27029, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27029A2A4P4 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm27029A2A4P4 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm27029A2A4P4 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms