Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
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Trav12-2A0N8N6 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Trav12-2A0N8N6 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Trav12-2A0N8N6 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Trav12-2A0N8N6 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Trav12-2A0N8N6 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Trav12-2A0N8N6 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Trav12-2A0N8N6 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Trav12-2A0N8N6 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trav12-2A0N8N6 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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