Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YDB2

4930469K13Rik, RIKEN cDNA 4930469K13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930469K13RikA0A286YDB2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930469K13RikA0A286YDB2 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
4930469K13RikA0A286YDB2 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
4930469K13RikA0A286YDB2 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930469K13RikA0A286YDB2 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930469K13RikA0A286YDB2 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930469K13RikA0A286YDB2 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930469K13RikA0A286YDB2 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930469K13RikA0A286YDB2 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930469K13RikA0A286YDB2 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930469K13RikA0A286YDB2 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930469K13RikA0A286YDB2 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930469K13RikA0A286YDB2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930469K13RikA0A286YDB2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930469K13RikA0A286YDB2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930469K13RikA0A286YDB2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930469K13RikA0A286YDB2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930469K13RikA0A286YDB2 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930469K13RikA0A286YDB2 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930469K13RikA0A286YDB2 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930469K13RikA0A286YDB2 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930469K13RikA0A286YDB2 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930469K13RikA0A286YDB2 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930469K13RikA0A286YDB2 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930469K13RikA0A286YDB2 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930469K13RikA0A286YDB2 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms