Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P8

Trbv13-1, T cell receptor beta, variable 13-1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms