Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms