Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3550W4VSN7 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms