Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z309

Cib2, Calcium and integrin-binding family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib2Q9Z309 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cib2Q9Z309 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cib2Q9Z309 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cib2Q9Z309 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cib2Q9Z309 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cib2Q9Z309 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cib2Q9Z309 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cib2Q9Z309 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cib2Q9Z309 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cib2Q9Z309 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cib2Q9Z309 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cib2Q9Z309 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cib2Q9Z309 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cib2Q9Z309 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cib2Q9Z309 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cib2Q9Z309 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cib2Q9Z309 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cib2Q9Z309 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cib2Q9Z309 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cib2Q9Z309 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cib2Q9Z309 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cib2Q9Z309 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cib2Q9Z309 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cib2Q9Z309 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Cib2Q9Z309 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cib2Q9Z309 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cib2Q9Z309 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cib2Q9Z309 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cib2Q9Z309 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cib2Q9Z309 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cib2Q9Z309 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cib2Q9Z309 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cib2Q9Z309 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cib2Q9Z309 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cib2Q9Z309 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cib2Q9Z309 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cib2Q9Z309 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cib2Q9Z309 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cib2Q9Z309 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cib2Q9Z309 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cib2Q9Z309 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cib2Q9Z309 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cib2Q9Z309 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cib2Q9Z309 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cib2Q9Z309 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cib2Q9Z309 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cib2Q9Z309 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cib2Q9Z309 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cib2Q9Z309 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cib2Q9Z309 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cib2Q9Z309 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cib2Q9Z309 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cib2Q9Z309 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cib2Q9Z309 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cib2Q9Z309 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cib2Q9Z309 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cib2Q9Z309 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cib2Q9Z309 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cib2Q9Z309 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cib2Q9Z309 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cib2Q9Z309 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cib2Q9Z309 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cib2Q9Z309 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cib2Q9Z309 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cib2Q9Z309 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cib2Q9Z309 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cib2Q9Z309 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cib2Q9Z309 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cib2Q9Z309 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cib2Q9Z309 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cib2Q9Z309 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cib2Q9Z309 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cib2Q9Z309 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cib2Q9Z309 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cib2Q9Z309 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cib2Q9Z309 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cib2Q9Z309 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cib2Q9Z309 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cib2Q9Z309 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cib2Q9Z309 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cib2Q9Z309 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cib2Q9Z309 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cib2Q9Z309 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cib2Q9Z309 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cib2Q9Z309 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cib2Q9Z309 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cib2Q9Z309 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cib2Q9Z309 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cib2Q9Z309 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cib2Q9Z309 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cib2Q9Z309 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cib2Q9Z309 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cib2Q9Z309 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cib2Q9Z309 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cib2Q9Z309 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cib2Q9Z309 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cib2Q9Z309 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cib2Q9Z309 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cib2Q9Z309 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cib2Q9Z309 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms