Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hdac5Q9Z2V6 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms