Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms