Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd1Q9Z2E2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms