Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms