Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ap3b1Q9Z1T1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms